Священник Иоанн родился 13 ноября 1873 года в селе Толобино Серпуховского уезда в семье священника Луки Калабухова.
С 1900 года работал в Москве в булочной приказчиком. В 1908 году переехал в Архангельск, где год работал весовщиком на железнодорожной станции, а потом приказчиком у частного булочника. В 1915 году Иван Лукич поступил в Архангельскую Духовную семинарию, которую окончил экстерном. В апреле 1917 года он был рукоположен во священника ко храму в селе Ваймуга Холмогорского уезда Архангельской губернии.

Если свеча зажжена в комнате, то, пока она горит и светит, не будет темноты. Если пища посолена, она будет сохраняться от разложения. Если кто-то хранит слово Христово в душе своей, то он хранит и соль, и свет – и жизнь будет пребывать в нем. Такая душа не потемнеет в этой жизни и разлагающей смерти не изведает.