Отец святителя Серафима Иоанн Гаврилович принадлежал к известному роду Бонифатьевых, которые были старообрядцами, строгими поборниками Устава. Именно Иоанну Гавриловичу суждено было совершить решающий шаг к единению с Православной Церковью: он принял единоверие вместе с новой фамилией Звездинский. За свой поступок он был проклят своим отцом до третьего колена.

Позже, женившись на дочери единоверческого священника, Иоанн Гаврилович сам принял священство и стал служить в Ржеве. В 1880-е годы он уже был настоятелем Троицко-Введенского храма в Москве. Его авторитет был настолько велик, что многие приходившие, приезжавшие к нему старообрядцы переходили в единоверие. Вскоре отец Иоанн был назначен благочинным всех единоверческих церквей Москвы.