В 1918 году в возрасте 45 лет иеромонах Аполлинарий мученически погиб от
рук красноармейцев. Произошло это при следующих обстоятельствах.
Военно-оперативный штаб по борьбе с контрреволюцией в июле 1918 года
потребовал от настоятеля немедленно командировать священника для
служения в селе Красногорском. В силу этого безапелляционного требования
власти для служения при Спасской церкви села Красногорского был
командирован иеромонах Аполлинарий, так как местный священник, отец
Александр Чернавин, был арестован, а после освобождения большевики
запретили ему служить.